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Western blot常見問題分析(上)

Western blot(WB)是實驗室中常見且重要的一種分子生物學(xué)實驗方法。

具體的實驗原理和實驗步驟在前幾期中已經(jīng)做了詳細(xì)的介紹,實驗步驟大致分為:蛋白提取、蛋白定量、SDS-PAGE電泳、轉(zhuǎn)膜、封閉、一抗孵育、清洗、二抗孵育、清洗、蛋白檢測。步驟復(fù)雜,耗時長,容易出現(xiàn)各種問題,尤其對于新手來說更是一個挑戰(zhàn)。為了讓大家能夠?qū)⑦@個實驗做到完美,本期就簡單向大家總結(jié)歸納了WB實驗中常見的一些問題,并給出了解決方案,目的是為了讓大家了解WB實驗中的注意點和規(guī)范操作的必要性,同時也是方便大家在出現(xiàn)問題后能夠及時分析出原因,調(diào)整實驗方案,得到預(yù)期結(jié)果。        

我們將常見問題總結(jié)歸納為背景高、條帶形狀異常、非特異性條帶、沒有條帶或條帶弱4大類,本期我們首先介紹背景高和條帶形狀異常這兩種常見問題。

一、背景高

原因分析 建議解決方案
膜封閉不充分 延長封閉時間;更換更加合適的封閉液
一抗孵育濃度高 降低一抗稀釋濃度,可減少非特異性條帶
一抗孵育溫度偏高 建議4℃過夜孵育
膜清洗不充分 可適當(dāng)增加清洗次數(shù)和時間
膜在實驗過程中干過 整個實驗過程中保持膜濕潤
曝光時間過長 根據(jù)條帶背景,適當(dāng)減少曝光時間
轉(zhuǎn)膜液,封閉液等不新鮮或可能被污染 現(xiàn)配現(xiàn)用

二、條帶形狀異常

微笑條帶

皺眉條帶

啞鈴條帶

條帶串孔

豎條紋條帶

條帶拖尾

條帶變形

條帶變形

條帶上有白色圓圈

條帶反白

條帶類型 原因分析 建議解決方案
微笑條帶(︶) 電泳電流不均一 需更換電泳槽或兩邊的邊緣孔不加樣本
凝膠冷卻不均勻 重新配制凝膠
電泳速度過快 可減少電壓等減慢電泳速度
轉(zhuǎn)膜溫度過高 可在冷室或者冰浴中進(jìn)行轉(zhuǎn)膜
皺眉條帶(⌒) 可能是凝膠和玻璃擋板底部有氣泡,或者兩邊聚合不完全 可通過調(diào)整裝置來避免該問題
啞鈴條帶 SDS-PAGE膠配制時凝固的不均勻 需要重新配膠
樣品可能含有過多雜質(zhì) 樣品使用前對其進(jìn)行離心,以去除過多雜質(zhì)
條帶串孔 上樣量高 需降低上樣量
制膠問題,分離膠和濃縮膠之間有間隙 重新配膠
豎條紋條帶 上樣樣品中存在不溶性顆粒 上樣前離心去除顆粒
膜上的黑點和黑斑可能是封閉液溶解不完全或是封閉液放置過久 過濾封閉液或者更換封閉液
條帶拖尾 一抗?jié)舛雀?,孵育時間久 降低一抗?jié)舛群头跤龝r間
蛋白濃度高 降低上樣量
樣品溶解不好 重新溶解樣品,上樣前可離心,優(yōu)化蛋白提取的方法
電泳液、轉(zhuǎn)膜液使用次數(shù)過多 現(xiàn)配現(xiàn)用
蛋白樣品降解 提取蛋白是可加蛋白酶抑制劑,全程冰上操作
分離膠濃度大 根據(jù)目的蛋白分析大小,選擇合適濃度的分離膠
條帶變形 膠中有氣泡或者不溶性顆粒 確保配膠試劑中無雜質(zhì)
蛋白樣品降解 提取蛋白時可加蛋白酶抑制劑,全程冰上操作
條帶上有白色圓圈 轉(zhuǎn)膜時出現(xiàn)氣泡 在轉(zhuǎn)膜過程中要盡量去除氣泡,使膜、濾紙和膠緊密結(jié)合
反白條帶 一抗?jié)舛冗^高,二抗上HRP催化活力太強(qiáng),同時顯色底物處于臨界點,反應(yīng)時間不長,將周圍底物催化完,形成了空白HRP 結(jié)合物濃度過高 可降低一抗和二抗?jié)舛龋蛘吒鼡Q底物

(發(fā)布于:2022-04-15)